Thời gian gần đây, tình hình khai thác thủy sản mang tính hủy diệt đang xảy ra khá phức tạp trên vùng phá Tam Giang, đặc biệt là tình trạng sử dụng xung điện đặt trên chiếc Cô le và sử dụng cào lươn, cào hến gắn trên đò máy để khai thác thủy sản. Đối tượng khai thác trái phép chủ yếu là người của các địa phương khác đến. Họ thường dùng thuyền máy công suất lớn đi thành nhóm từ 10 đến 15 người, sử dụng kích điện, cào lươn, cào hến đánh bắt thủy sản mang tính hủy diệt. Một số trường hợp đã cắt lưới vào khai thác ngay trong hồ nuôi tôm của ngư dân ở xã Quảng An, Quảng Phước để khai thác tôm.